组织部门做好干部监督工作的指导思想是，以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，从关心爱护干部的目的出发，坚持实事求是的原则和惩前毖后、治病救人的方针，充分发挥组织部门担负干部管理工作的有利条件，既要“亡羊补牢”，又要“未雨绸缪”，切实保证各级组织人事部门按照党的原则和规定的程序选拔任用干部，努力把干部特别是领导干部中出现的问题消除在萌芽状态，提高干部的政治思想素质和拒腐防变能力，为加强领导班子和干部队伍建设服务，为贯彻执行党的吞噬星空基本路线服务。